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小鼠品系的命名基本原则

遗传修饰动物的命名:

1、 转基因大小鼠

命名:一个转基因品系名称符号由以下五部分组成,均以罗马字体表示:

格式:背景品系-Tg(基因名称)##/实验室代码,##表示实验室或机构指定序号。

例:C57BL/6JGpt-Tg(CD8)23/Gpt

C57BL/6JGpt表示受体品系,写品系全称。

Tg表示转基因

CD8表示转入基因名称,写在括号内。

当转入基因为在单独基因时,写该基因的官方符号(Official symbol),如CD8、PDCD1等。

当转入基因为多基因时,不同基因之间用英文逗号“,”分隔,如APP, PS1、HLA-B*2705, B2M等。

当转入基因为在特定启动子驱动下的基因片段时,写启动子-基因名称,如Nes-Cre、ACTB-EGFP等。

当转入基因为两个基因的嵌合序列时,用英文斜杠“/”分隔两个基因,如BCR/ABL等。

23表示实验室或机构指定序号,通常为Founder鼠的编号,也可为实验室另行指定的特定编号;

Gpt表示实验室或机构在ILAR注册的实验室代码(如:集萃药康的实验室代码为Gpt)。

2、 打靶突变大小鼠

定义:通过ES打靶介导的同源重组获得的突变大小鼠品系。

命名:由背景品系名、基因名、基因修饰类型、实验室或机构指定序号及实验室代码组成,品系名和基因名称以连字符分开,实验室代码前面加/进行间隔。

格式:背景品系-基因名称基因修饰类型##/实验室代码,##表示实验室或机构指定序号。

例如:C57BL/6JGpt-Ctnnb1tm1/Gpt

3、 核酸内切酶介导的突变大小鼠

定义:通过Talen、CRISPR/Cas9编辑技术获得的突变大小鼠品系。

命名:由背景品系名、基因名、基因修饰类型、实验室或机构指定序号及实验室代码组成,品系名和基因名称以连字符分开,实验室代码前面加/进行间隔。

格式:背景品系-基因名称基因修饰类型##/实验室代码,##表示实验室或机构指定序号。

例如:NOD/ShiLtJGpt-Prkdcem26Cd52/Gpt

NOD/ShiLtJGpt表示背景品系;

Prkdc表示靶基因,写基因官方符号(Official symbol),斜体。

em是endonuclease-mediated mutation的缩写,表示该品系为核酸内切酶介导的突变品系,大写C代表CRISPR/Cas9方法制作,大写T代表Talen方法制作;em后面的符号代表基因编辑类型:d代表deletion,in代表insert,d或in后面的数字代表删除或者敲入片段的大小,斜体。

em后面的数字代表实验室或机构指定序号,通常为founder鼠的编号,也可为实验室另行指定的特定编号, 斜体。

对于未确定具体突变信息,仅有表型特征的突变,可使用表型名称命名,如Prkdcscid、Apcmin等,斜体。

对于已经确定具体突变信息的,标明具体突变信息,例如:KrasG12C、SOD1G93A等。

Gpt表示实验室或机构在ILAR注册的实验室代码(如:集萃药康的实验室代码为Gpt)。

参考网址:

集萃药康微信公众号20200416推文(作为有身份的小鼠,认识我从我的名字开始)

http://informatics.jax.org/mgihome/nomen/gene.shtml#tarm

http://informatics.jax.org/mgihome/nomen/anomalies.shtml

https://www2.jax.org/nomenclature-tutorial/#

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